В Японии базовые кроссоверы оснащаются 120-сильным (145 Нм) бензиновом безнаддувным трёхцилиндровым двигателем 1.5, а топ-версиям положена гибридная 116-сильная установка, состоящая из того же «атмосферника», электромотора и вариатора. Механический полный привод с муфтой — опция для обычных Yaris Cross, а для гибридов можно заказать систему E-Four с электромотором в приводе задней оси.